Penyebabnya akibat belum terbangunnya ekosistem inovasi nasional yang kondusif bagi pengembangan sains dan teknologi, baik pada aspek regulasi, tatakelola, alokasi sumberdaya, dan pengaturan kelembagaan.
Dari sisi kelembagaan, sinergi dan kolaborasi tiga pihak (Triple-Helix) antara perguruan tinggi/lembaga riset, pemerintah, dan dunia usaha juga belum menunjukkan kinerja yang memadai.
Berlandaskan pada strategi Triple Helix ini, jelas Pontjo, pengembangan sains dan teknologi tidak bisa berjalan sendiri-sendiri, melainkan harus ada upaya sinergetik dari semua terutama ketiga pihak tersebut.
Pontjo menegaskan sinergi dan kolaborasi antara pemerintah, perguruan tinggi/lembaga riset, dan industri/dunia usaha, serta pemberdayaan masyarakat sangat penting.
Terutama dalam upaya mendekatkan hasil riset dan inovasi kepada dunia usaha/industri atau masyarakat untuk penerapan, pemanfaatan hingga pemasarannya.
Sampai saat ini, upaya pemanfaatan hasil riset dan inovasi teknologi yang dihasilkan oleh lembaga riset/perguruan tinggi masih menghadapi berbagai masalah.
Salah satunya karena adanya jurang yang sangat lebar antara lembaga riset/perguruan tinggi di satu sisi, dan dunia usaha/industri di sisi lain.